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第一章 绪论 1

第一节 分子诊断学的概念、任务和特点 1

第二节 分子诊断学的发展简史 1

第三节 分子诊断的基本策略及其在医学中的应用 3

第四节 展望 5

第二章 基因、基因组与分子标志物 6

第一节 基因及其结构 6

一、基因的概念 7

二、原核生物基因的结构 7

三、真核生物基因的结构 7

第二节 基因组 8

一、原核生物基因组 8

二、真核生物基因组 11

三、病毒基因组 15

第三节 基因表达与表观遗传 17

一、基因表达的方式 17

二、基因表达的时空特异性 18

三、基因表达的调节 18

四、表观遗传 19

第四节 常见分子标志物 20

一、DNA分子标志物 20

二、RNA分子标志物 22

三、其他分子标志物 23

第三章 样本的采集与处理 24

第一节 样本的采集、运送与保存 24

一、样本的采集与处理 24

二、样本采集与处理的注意事项 25

三、样本的运送与保存 25

第二节 核酸的分离与纯化 26

一、DNA的分离与纯化 26

二、RNA的分离与纯化 28

三、核酸浓度、纯度与完整性的检测 29

第三节 蛋白质的分离与纯化 30

一、蛋白质分离纯化的基本原则 30

二、蛋白质分离纯化的技术方法 30

三、蛋白质浓度与纯度的检测 32

第四章 核酸分子杂交技术 34

第一节 核酸分子杂交的基本原理 34

一、核酸变性 34

二、核酸复性 34

三、核酸分子杂交 35

四、核酸分子杂交的影响因素 35

第二节 核酸探针 35

一、核酸探针的种类 36

二、核酸探针的标记 36

三、核酸探针的纯化 41

四、核酸探针的检测 41

第三节 核酸分子杂交的类型 43

一、固相核酸分子杂交 43

二、液相核酸分子杂交 51

第五章 核酸扩增技术 53

第一节 聚合酶链反应技术 54

一、PCR原理 54

二、PCR反应体系及其优化 55

三、扩增产物的检测与分析 58

四、常见问题原因分析与处理 59

五、PCR衍生技术 60

第二节 荧光定量PCR 63

一、荧光定量PCR简介 64

二、荧光定量PCR技术原理 64

三、荧光定量PCR的方法 67

四、荧光定量PCR测定的数据处理 70

五、实时荧光定量PCR技术的应用 72

第三节 其他核酸扩增技术 72

一、基于转录扩增技术 73

二、探针扩增技术 74

三、信号扩增技术 75

第六章 基因芯片技术 78

第一节 基因芯片基本原理 79

第二节 基因芯片分类 79

一、根据生产工艺分类 79

二、根据检测项目分类 80

第三节 基因芯片检测流程 82

一、基因芯片诊断技术管理规范 82

二、目的核酸的制备 82

三、分子杂交与洗脱 84

四、基因芯片的图像扫描 85

第四节 基因芯片生物信息学分析 85

一、基因芯片的图像处理 85

二、图像读数标准化 85

三、显著性分析 86

四、基因表达聚类分析 87

五、基因功能注释归类 87

六、基因芯片实验数据标准 88

七、基因芯片数据可靠性验证 89

第五节 基因芯片的临床应用 89

一、疾病的诊断和治疗 90

二、药物筛选及用药指导 90

三、产前筛查与诊断 91

第七章 核酸测序技术 92

第一节 核酸测序技术原理 92

一、第一代核酸测序技术原理 92

二、第二代核酸测序技术原理 95

三、第三代测序技术原理 100

第二节 核酸测序技术流程 101

一、DNA测序技术流程 101

二、RNA测序技术流程 104

第三节 核酸测序数据生物信息学分析 107

一、DNA测序数据生物信息学分析 107

二、RNA测序数据生物信息学分析 109

第四节 核酸测序技术的应用 111

一、DNA测序技术的应用 111

二、RNA测序技术的应用 112

第八章 蛋白质组学技术 114

第一节 蛋白质组学研究基本技术 114

一、双向凝胶电泳技术 114

二、生物质谱技术 117

三、蛋白质芯片技术 119

四、蛋白质印迹法 121

第二节 蛋白质间相互作用的研究技术 122

一、酵母双杂交技术 122

二、免疫共沉淀技术 124

第三节 蛋白质组学的生物信息学分析 125

一、蛋白质定性鉴定 126

二、蛋白质翻译后修饰分析 127

第九章 感染性疾病的分子诊断 130

第一节 感染性疾病的分子诊断策略 130

第二节 常见病毒感染的分子诊断 131

一、乙型肝炎病毒 131

二、丙型肝炎病毒 134

三、人乳头瘤病毒 136

四、流行性感冒病毒 139

五、人类免疫缺陷病毒 140

第三节 常见细菌感染的分子诊断 143

一、结核分枝杆菌 143

二、淋病奈瑟菌 145

第四节 常见真菌感染的分子诊断 147

一、白假丝酵母菌的基因组结构特征 147

二、白假丝酵母菌的分子诊断 147

三、白假丝酵母菌分子诊断的临床意义 148

第五节 其他病原体的分子诊断 148

一、沙眼衣原体 148

二、解脲脲原体 149

三、梅毒螺旋体 150

第十章 单基因遗传病的分子诊断 152

第一节 单基因遗传病的分子基础和分子诊断策略 152

一、单基因遗传病的分子基础 152

二、单基因遗传病的分子诊断策略 154

第二节 常见单基因遗传病的分子诊断 155

一、血红蛋白病 155

二、血友病A 162

三、肌营养不良症 165

四、脆性X综合征 168

第三节 线粒体DNA突变相关疾病的分子诊断 170

一、Leber遗传性视神经病变 170

二、线粒体肌病脑病伴乳酸酸中毒及卒中样发作综合征 172

第十一章 肿瘤的分子诊断 175

第一节 肿瘤的分子诊断策略 175

第二节 肿瘤分子诊断的生物标志物 176

一、肿瘤相关的染色体异常 176

二、肿瘤相关的基因异常 177

三、肿瘤相关的单核苷酸多态性 182

四、肿瘤相关的表观遗传异常 182

第三节 肿瘤分子诊断的临床应用 182

一、肺癌 183

二、乳腺癌 184

三、结直肠癌 185

四、白血病 187

五、前列腺癌 188

第十二章 药物相关基因的分子诊断 191

第一节 药物基因组学 191

一、药物基因组学概念 191

二、药物基因组学研究范畴 192

三、药物相关基因分类 192

第二节 药物相关基因及其检测 193

一、药物作用靶点相关基因 193

二、药物代谢相关基因 200

三、药物副作用相关基因 204

第十三章 分子诊断技术的其他应用 207

第一节 染色体病的分子诊断技术 207

一、染色体疾病 207

二、染色体疾病的分子诊断技术 208

第二节 移植配型中的分子诊断技术 213

一、HLA配型的分子生物学基础 213

二、HLA分型技术 213

三、HLA分型技术的临床应用 215

第三节 法医物证学中的分子诊断技术 216

一、法医物证鉴定遗传标记的选择 216

二、法医物证鉴定常用遗传标记与分子诊断 217

第十四章 临床分子诊断的质量控制 220

第一节 临床分子诊断质量控制的概述 220

一、临床分子诊断质量控制基本概念 220

二、临床分子诊断质量控制的相关规定 221

第二节 临床分子诊断的质量控制 221

一、临床分子诊断工作基本原则 221

二、检验前过程质量控制 224

三、检验过程中的质量控制 225

四、分析后质量控制 228

索引 230

英文索引 230

中文索引 234

参考文献 238