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第一章 绪论 1

第一节 技术创新促进微生物学的进步与发展 1

第二节 微生物学研究技术 3

第三节 “组学”时代的微生物学 6

第二章 原核生物 11

第一节 原核生物的分类与系统学 11

第二节 细菌 15

第三节 古生菌 31

第四节 极端微生物 48

第三章 真核微生物 54

第一节 真核微生物的分类与系统发育 54

第二节 酵母菌 61

第三节 霉菌 66

第四节 蕈菌 80

第四章 无细胞结构生物——病毒 96

第一节 概述 96

第二节 噬病毒体 98

第三节 病毒生态学 105

第四节 新生病毒 113

第五章 微生物的代谢 121

第一节 微生物的代谢体系 121

第二节 代谢途径的调控 134

第三节 代谢流分析 142

第六章 微生物的遗传与育种 177

第一节 微生物基因组学 177

第二节 分子定向进化育种 196

第三节 基因组定点编辑技术 208

第七章 现代微生物生态学 228

第一节 现代微生物生态学的研究方法 228

第二节 微生物的多样性与微生物资源利用 247

第三节 微生物与生物地球化学循环 257

第四节 组学时代的微生物生态学 279

第八章 微生物的分类与鉴定 287

第一节 细菌种与物种形成 287

第二节 微生物分子鉴定技术 293

第三节 细菌鉴定实例 299

第四节 放线菌鉴定实例 309

第五节 酵母菌鉴定实例 315

第六节 真菌的分类与鉴定 320

第九章 微生物与食品 326

第一节 微生物与传统发酵食品 326

第二节 食品微生物快速检测技术 335

第三节 组学技术在食品安全中的应用 345

第四节 宏基因组学在食品工业中的应用 353

第十章 微生物与医药 360

第一节 抗生素 360

第二节 萜类化合物 370

第三节 甾体类化合物 376

第四节 微生物多糖 381

第五节 黄酮类化合物 391

第六节 生物活性肽 395

第七节 微生物产生的酶及酶抑制剂 396

第十一章 微生物与环境保护 398

第一节 环境微生物监测技术 398

第二节 微生物与水污染 405

第三节 微生物与大气污染 414

第四节 微生物对环境污染物的降解 416

第五节 微生物修复技术 435

第十二章 微生物与能源 440

第一节 生物质预处理及水解微生物 440

第二节 微生物与燃料乙醇 450

第三节 微生物与生物柴油 455

第四节 微生物与沼气发酵 462

第五节 微生物与生物制氢 470

第六节 微生物燃料电池 479

第十三章 微生物与农业 486

第一节 微生物农药 486

第二节 微生物肥料 500

第三节 微生物饲料 508

参考文献 515