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一、变化中的生物学 1

理性背景 1

古代 2

亚里斯多德 8

基督教的世界观 14

文艺复兴 19

笛卡尔 23

多样性的发现 28

自然神学 33

生命与发生 37

启蒙运动与生物学 39

巴黎——从布丰到居维叶 41

17世纪到19世纪科学的兴起 44

科学出版物 46

19世纪生物学的分裂 48

生理学进入成年期 50

达尔文主义 53

二十世纪的生物学 60

动物行为学和生态学 60

分子生物学的崛起 63

生物学史上的主要时代 68

生物学和哲学 72

现代生物学 78

二、宏观分类学，分类科学 81

多样性的范围 82

化石 91

系统学，多样性科学 93

系统学的结构 100

鉴定与分类 103

分类的作用 104

亚里斯多德 106

古代人和草药医生的植物分类 114

草药医生的分类 117

逻辑分类的下行分类 120

瑞与悌宇列弗 126

林奈以前的动物学家 133

林奈 142

林奈和高级阶元 146

属 149

林奈提出的性系统 152

布丰 156

动物分类学的复苏 160

居维叶利性状相关（correlation of characters） 161

拉马克 163

分类学性状 165

多性状分类单位（多征单位，Polythetic Taxa） 171

按经验归类的上行分类（UpwardClassification By Empirical Grouping） 172

阿丹森和多重性状的应用 178

过渡时期（1758—1859） 181

探索自祛系统（The search for a Natural system） 185

自然（界）阶梯 189

相似与同功（Affinity and Analogy） 191

实用主义与等级结构论 194

等级结构分类（Hierarchical classlfications） 197

高级阶元和分类单位的真实性 199

三、按照共同祖先分类 202

相似性（Affinity）的涵义 210

恢复连续性 211

宏观分类学的衰微 215

迫切需要新的分类方法 220

数值分类（Numerical phenetics） 222

支序分类（Cladistics） 229

支序分析 232

支序分类 236

传统的或进化分类方法 241

新的分类学性状 244

分类的认识论 249

信息检索的简易化 251

等级 251

分类单位的大小 252

对称性 254

顺序 255

系统学的现状与未来 257

多样性研究 260

四、微观分类学，关于物种的科学 268

物种分类单位与物种阶元（Species Taxon and SpeciesCategory） 271

早期的物种概念 273

本质论者的物种概念 276

林奈 279

布丰 283

唯名论的物种概念 288

达尔文的物种概念 291

生物学物种概念的萌芽 298

生物学（物）种的性质 303

新系统学 308

生物学物种概念的有效性 313

形态学的类似性（similarity；或同一性，identity） 316

边际状况或端始种 319

单亲繁殖（无性状态） 319

隔离机制的泄漏（杂交） 321

生物学物种概念在多因次（多维）物种分类单位中的运用 324

空间因次中的变异 326

种下阶元 327

多型种分类单位（polytypic species taxa） 330

时间因次中的变异 334

物种在生物学中的重要意义 339