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1 免疫信息学与计算机辅助预测免疫原性：导论 1

第1部分 数据库 10

2 国际免疫遗传学信息系统（IMGT） 10

3 IMGT／HLA数据库 27

4 免疫多态性数据库：IPD 39

5 T细胞表位查询和预测数据库：SYFPEITHI 49

6 T细胞表位、MHC结合肽和TAP结合肽的搜寻及描图 61

7 Bcipep数据库中B细胞表位的搜寻及描图 75

8 半抗原、载体蛋白和抗半抗原抗体的检索 84

第2部分 HLA超型鉴定 95

9 基于GRID／CPCA和层次聚类法的HLA超型分类 95

10 HLA-A2超型的结构基础 104

11 基于MHC结合肽库定义MHC超型 110

12 基于肽结合凹槽静电分布图的HLA-Ⅰ类等位基因分型 117

第3部分 肽与MHC结合能力的预测 123

13 特征参数法预测MHC结合肽 123

14 机器学习技术预测MHC结合肽 133

15 人工智能方法预测T细胞表位 144

16 小鼠MHC-多肽亲和力的预测 150

17 3D-QSAR模型预测MHC-多肽亲和力 164

18 基于MHC分子模型预测表位肽 175

19 基于支持向量机预测MHC结合肽 182

20 应用SVRMHC方法预测多肽与MHC分子的结合亲和力 189

21 基于结构及分子模拟预测HLA结合肽 195

22 基于结构预测MHC结合肽操作指南 200

23 MHC-Ⅰ及MHC-Ⅱ与肽结合的静态能分析 206

24 分子动力学模拟 214

25 一种预测MHC-Ⅱ类分子结合肽的迭代方法 229

26 MHC-Ⅱ类分子结合肽综合预测方法 237

27 基于贝叶斯神经网络的MHC-Ⅱ类分子-肽复合物非线性预测模型 244

第4部分 免疫系统其他特性的预测 253

28 TAPPred法预测抗原中的TAP结合肽 253

29 B细胞表位的预测方法 257

30 一种MHC分子结构功能相似性分析平台：HistoCheck 263

31 免疫相关性毒力因子的预测 271

索引 278