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第一章 蟹类线粒体DNA研究概况 1

1.1 蟹类线粒体DNA组成与特征 1

1.2 蟹类线粒体DNA多态性及其应用 3

1.2.1 线粒体DNA在蟹类分子系统学中的应用 4

1.2.2 线粒体DNA在蟹类分子群体遗传学中的应用 6

第二章 基于线粒体DNA的蟹类分子系统学 8

2.1 基于12S rRNA基因的蟹类分子系统学 9

2.1.1 基于12S rRNA基因的厚蟹分子系统分析 9

2.1.2 基于12S rRNA基因的牙买加中部溪流淡水蟹类分子系统分析 14

2.1.3 基于12S rRNA基因的4种青蟹分子系统分析 14

2.1.4 基于12S rRNA基因的中国沿海10种方蟹分子系统分析 15

2.2 基于16S rRNA基因的蟹类分子系统学 18

2.2.1 基于16S rRNA基因的厚蟹分子系统分析 18

2.2.2 基于16S rRNA基因的中国沿海10种方蟹分子系统分析 23

2.2.3 基于16S rRNA基因的东太平洋瓷蟹分子系统分析 26

2.2.4 基于16S rRNA基因的雕刻方蟹科构建 27

2.2.5 基于16S rRNA基因的台南泽蟹属蟹类分类系统的分子评估 29

2.2.6 基于16S rRNA基因的拟地蟹总科系统分类和生物地理学分析 30

2.2.7 基于16S rRNA基因的方蟹科蟹类系统发育关系重构 33

2.3 基于COI基因的蟹类分子系统学 34

2.3.1 基于COI基因的厚蟹分子系统分析 35

2.3.2 基于COI基因的中国沿海10种方蟹分子系统分析 46

2.3.3 基于COI基因的蟹类物种厘定 49

2.4 基于线粒体DNA多基因的蟹类分子系统学 52

2.4.1 基于12S rRNA和16S rRNA基因的蟹类分子系统分析 52

2.4.2 基于16S rRNA和COI基因的蟹类分子系统分析 55

2.4.3 基于12S rRNA、16S rRNA和COI等基因的蟹类分子系统分析 59

第三章 基于线粒体DNA的蟹类分子系统地理学 65

3.1 基于COI基因的蟹类分子系统地理学 66

3.1.1 基于COI基因的天津厚蟹和侧足厚蟹分子系统地理学 66

3.1.2 基于COI基因的印度洋锯缘青蟹分子系统地理学 76

3.1.3 基于COI基因的粗腿厚纹蟹群体遗传结构和分子系统地理学 76

3.1.4 基于COI基因的黄色食草蟹遗传结构和分子系统地理学 77

3.1.5 基于COI基因的波多黎各淡水蟹类分子系统地理学 77

3.1.6 基于COI基因的中国东海三疣梭子蟹的遗传分化 77

3.1.7 基于COI基因的北海道毛蟹的遗传分化和群体遗传结构 78

3.1.8 基于COI基因的海南岛拟穴青蟹群体遗传多样性 79

3.2 基于16S rRNA基因的蟹类分子系统地理学 79

3.3 基于ND2基因的蟹类分子系统地理学 81

3.4 基于Cytb和COI基因的蟹类分子系统地理学 81

3.5 基于16S rRNA和COI等基因的蟹类分子系统地理学 83

展望 87

参考文献 88