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《科学专著丛书》序 1

序言 1

第1章 生物手性的起源 1

1.1 引言——生命进化时标和地外生命问题 1

目录 1

1.2 分子手性和光活性 5

1.3 光活性的微观理论 11

1.4 分子手性的起源和发展 14

1.5 β衰变电子和手性分子的相互作用 25

1.6 化学反应动力学的对称性破缺 31

1.7 手性聚合链的合作产生 36

1.8 手性系统的演化问题 38

1.9 前RNA世界和光活性 展望 50

参考文献 53

2.1 遗传密码的发现 56

第2章 遗传密码的逻辑和进化 56

2.2 遗传密码的进化和古密码的可能形式 61

2.3 遗传密码的对称性 67

2.4 遗传密码的阴阳对偶性 72

2.5 遗传密码的简并规则 78

2.6 终止密码子在密码表上的分布 87

2.7 密码表中氨基酸的亲水-疏水畴 93

2.8 普适密码的反常，氨基酸的简并度 102

2.9 遗传密码突变危险性的全局极小化 107

2.10 密码表突变危险度的进一步讨论 114

2.11 密码子使用频率 118

2.12 氨基酸突变的统计理论 127

参考文献 133

3.1 群体的基因动力学 135

第3章 序列的进化和基因信息学 135

3.2 分子进化速率 149

3.3 基因组中信息的积累 157

3.4 基因组的尺度和结构 161

3.5 核苷酸的统计关联及其短程为主性 168

3.6 基因序列信息参数的进化相关性 183

3.7 基因序列中的偏好模 189

3.8 序列的谱分析与碱基长程关联 201

3.9 序列的阅读框架和不均匀性 210

3.10 DNA行走与分维 216

3.11 核苷酸频数的图示 223

3.12 马尔可夫链与核酸概率矩阵 227

参考文献 235

4.1 序列进化机制——最大信息原理（MIP） 239

第4章 序列的进化和基因信息学（续） 239

4.2 分子进化树 247

4.3 基因的复制、移位和横向进化 258

4.4 DNA保守位点和双螺旋结构局部偏差 265

4.5 序列进化方程 277

4.6 序列的复杂性 302

4.7 基因表达、密码子使用与碱基关联 310

4.8 构象动力学和蛋白质折叠速率 323

4.9 从序列到结构的反向生物学路线 331

4.10 蛋白质的框架结构 结构进化的保守性 346

参考文献 365

结束语：分子进化的几个普适性质 369

附录 371

主题索引 376